Es sabido que los profesores tienen a su cargo conducir el rumbo académico de una institución educativa. Sin embargo, las nuevas maneras de enseñar y hacer investigación limitan que los profesores funcionen como individuos aislados y que se prefiera el trabajo colegiado o grupal, sobre el individual, para propiciar la necesaria vinculación de la generación y aplicación del conocimiento con el exterior de la institución. Por ello, la Secretaría de Educación Pública (SEP), a través del Programa de Mejoramiento del Profesorado (PROMEP) promueve la formación de cuerpos académicos de profesores, grupos académicos que les permiten reflexionar sobre los objetos de estudio y sobre el avance de las disciplinas y hacer un trabajo más eficiente. Los cuerpos académicos son grupos de profesores-investigadores de tiempo completo que comparten una o varias líneas de generación y aplicación innovadora del conocimiento (investigación o estudio) en temas disciplinares o multidisciplinares y un conjunto de objetivos y metas académicos destinados a la generación y/o aplicación de nuevos conocimientos (Diario Oficial de la Federación, tercera sección, acuerdo 417 del 30 de diciembre de 2007).


En congruencia con los planteamientos de la SEP-PROMEP, en el año 2002 los profesores del Campus de Ciencias Biológicas y Agropecuarias conformaron Cuerpos Académicos. Éstos atienden los programas educativos de la institución (Licenciatura en Agroecología, Licenciatura en Biología, Licenciatura en Biología Marina, Licenciatura en Medicina Veterinaria y Zootecnia, Maestría en Producción Ovina Tropical, y Posgrado Institucional en Ciencias Agropecuarias y Manejo de Recursos Naturales Tropicales) además de realizar labores de investigación, difusión y vinculación, para dar cumplimiento cabal de las funciones de la dependencia y de la Universidad. Actualmente el CCBA cuenta con diez cuerpos académicos.

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Facultad de ingeniería química 

Biotecnología y bioingeniería 
Desarrollo alimentario

Centro de Investigaciones regionales Dr. Hideyo Noguchi

Biomedicina de Enfermedades Infecciosas
Enfermedades Infecciosas Transmitidas por Vector 
Vigilancia Ecológica y Geográfica de la Zoonosis de la Península de Yucatán